More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1113 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1113  integrase  100 
 
 		 407 aa  850    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  40.15 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  34.33 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  34.33 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  32.51 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  31.25 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  31.02 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  29.97 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  29.1 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  28.82 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  29.51 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  28.26 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  27.1 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  26.35 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  25.96 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  28.36 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  28.36 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  25.56 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  31.28 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  30.41 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  30.42 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  28.69 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  23.74 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  27.89 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  41.25 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  30 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  25.84 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.71 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  27.49 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  38.1 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.62 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  47.54 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  44.12 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  25.4 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.45 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  44.78 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  34.18 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.71 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.79 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  46.67 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  44.12 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  21.65 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  24.14 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.56 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  38.57 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.3 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.89 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  23.41 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  33.71 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  39.13 
 
 		 321 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  22.39 
 
 		 311 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.31 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  23.99 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  27.37 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  40.3 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  25.58 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  40.91 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  39.73 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.46 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  33.33 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  40.91 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.79 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.85 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  40.3 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  42.86 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  40.91 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.81 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  23.67 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  33 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  40.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  23.75 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  40.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>