More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1936 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  100 
 
 		 391 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  40.97 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  31.15 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  24.86 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.64 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.17 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.29 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.63 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  24.46 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.99 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  25.94 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.5 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.4 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.57 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.74 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  26.67 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  23.42 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  25.31 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  25.31 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  26.32 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.53 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.49 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.83 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  30.69 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  25.47 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.65 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.54 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  25 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  21.94 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.06 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.52 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  24.29 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  24.9 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.36 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.71 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  23.83 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.16 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  23.68 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  22.41 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  21.71 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  21.71 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.91 
 
 		 687 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  23.08 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  25.69 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.41 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  24.76 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.52 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  22.7 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  21.71 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  23.74 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  23.93 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  22.61 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.21 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  24.92 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  25.29 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.16 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.52 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.66 
 
 		 276 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  21.23 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  23.5 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  21.25 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  22.41 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  26.33 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  27.8 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  27.23 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.99 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  21.84 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  27.02 
 
 		 564 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  23.31 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.88 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  20.95 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  20.95 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  24.8 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.46 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  22.86 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.79 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  20.72 
 
 		 387 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.65 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  23.33 
 
 		 338 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>