More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2359 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  100 
 
 		 398 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  49.61 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  45.91 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  44.87 
 
 		 381 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  37.09 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  37.36 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  35.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  32.63 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.42 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  41.03 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 367 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.9 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.24 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  29.18 
 
 		 334 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  39.58 
 
 		 159 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.16 
 
 		 275 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  34.21 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  38.51 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  37.06 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.62 
 
 		 296 aa  86.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  29.21 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.08 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.71 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  35.46 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  27.47 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.69 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.16 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.93 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  36.02 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  38.19 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  34.44 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.08 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.9 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  29.78 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  34.22 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  34.22 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.26 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  28.52 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  33.97 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  35.9 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  34.67 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.37 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  26.45 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.94 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  28.78 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.17 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  28.36 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  27.85 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  33.52 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  28.3 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  36.62 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.49 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.47 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  30.86 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  29 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.19 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  36.81 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  28.63 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  28.27 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.13 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  26.61 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  33.75 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.67 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.82 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  29.3 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.74 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.77 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.92 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  27.51 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.13 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>