204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0962 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  100 
 
 		 371 aa  768    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  42.42 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  40.22 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  40 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2734  integrase family protein  33.83 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  28.41 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  35.22 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  36.62 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.12 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.83 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  24.84 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.6 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.57 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  22.78 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  29.73 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  24.84 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  24.84 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.2 
 
 		 159 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  33.54 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  22.06 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  22.06 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  22.06 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2414  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  21.76 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  22.86 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  31.43 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  22.86 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.57 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.66 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 		 172 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29.78 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  25 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  22.26 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  25 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.11 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.07 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.83 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.69 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  23.72 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.99 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  31.43 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.27 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.57 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.54 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.7 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.7 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.78 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  22.58 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25 
 
 		 389 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.21 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.47 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  31.13 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.08 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.42 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  22.96 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  26.92 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.28 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.56 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.46 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.2 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.29 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.84 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  27.54 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.59 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  27.98 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  21.43 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  26.74 
 
 		 310 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  21.43 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.8 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  32.28 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>