More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2782 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  100 
 
 
356 aa  735    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  68.53 
 
 
342 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  49.41 
 
 
343 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  43.82 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  32.29 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.47 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.49 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.82 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  29.39 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.72 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.99 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.46 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.44 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  32.06 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  32.06 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.28 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.67 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.76 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.91 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  27.78 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.57 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.66 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.37 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.02 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
299 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
299 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.02 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.82 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  26.34 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.58 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.69 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  27.85 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  27.04 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.36 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.37 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.69 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.34 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.96 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.89 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.11 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.91 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.87 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.87 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  31.08 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.35 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.37 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.9 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  31.72 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  21.47 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.54 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.95 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.92 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.49 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  28.66 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  29.34 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  26.27 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.49 
 
 
295 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 
159 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  28.2 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  30.05 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.65 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.92 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.62 
 
 
275 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.43 
 
 
251 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  25.56 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.69 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  29.93 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.53 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.76 
 
 
393 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.27 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.32 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.77 
 
 
471 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  23.58 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  29.84 
 
 
415 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>