242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1985 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  100 
 
 		 469 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  36.4 
 
 		 503 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  28.02 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.29 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.46 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.38 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.93 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.15 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.65 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.1 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.68 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.12 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.81 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.21 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.31 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.13 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  28.91 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.65 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  28.24 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.04 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.12 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  26.11 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.68 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.35 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  27.94 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.47 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  22.72 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  22.88 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.97 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.38 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.38 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.88 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.07 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  33.16 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  30.69 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.98 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.26 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.16 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  21.93 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.25 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  22.8 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.09 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  25.79 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  21.68 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  19.76 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.13 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.12 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  26.69 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.76 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.51 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  22.83 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.16 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.41 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.87 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.42 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.84 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.95 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.34 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  20.92 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.34 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.87 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.6 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.49 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.73 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.42 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  21.35 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.77 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.61 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.34 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.83 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  20.63 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  24.37 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  20.39 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.07 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  21.62 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  24.05 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>