More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0121 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  861    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  46.27 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  45.21 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  41.33 
 
 		 404 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  38.85 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  34.92 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.93 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.71 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.71 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.52 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.09 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.49 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.25 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.58 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.29 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.66 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.66 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.38 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.59 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.61 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.23 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  28.64 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.4 
 
 		 370 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.24 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.11 
 
 		 477 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.4 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.94 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.72 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.85 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.88 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.22 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.04 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  25.73 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.27 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.32 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  27.75 
 
 		 375 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.44 
 
 		 357 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.55 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.11 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  22.37 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.28 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.12 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.58 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.48 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  26.67 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.27 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.22 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.22 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.36 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.12 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  25.83 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.37 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.98 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  24.56 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.15 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  29.12 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.42 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.12 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.34 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  27.67 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.87 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3352  hypothetical protein  60.71 
 
 		 83 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  29.3 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.74 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.74 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.69 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  24.93 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.2 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.25 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  20.83 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  20.83 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.5 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  25.61 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.54 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.83 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3058  hypothetical protein  23.33 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0437439  normal  0.0339147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.47 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>