43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3058 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3058  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0437439  normal  0.0339147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  23.85 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.3 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25.69 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.82 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.02 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.49 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.09 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  25.65 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  24.91 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  28.33 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  23.25 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  24.82 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.09 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  24.07 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  25.44 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.09 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 368 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  23.63 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.82 
 
 		 374 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.82 
 
 		 374 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  23.41 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.39 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  23.02 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.12 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  21.99 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  23.8 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.97 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.54 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.22 
 
 		 383 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>