21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1905 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  889    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  32.9 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  30.05 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  30.02 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 353 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  29.08 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  30.63 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  28.07 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  25.33 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  38.32 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.26 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  43.86 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  23.99 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  26.77 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.43 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  55 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  24.46 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  21.82 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.85 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.06 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>