110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0209 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  100 
 
 		 379 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  46.46 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  32.32 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  31.06 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2898  phage-related integrase  93.83 
 
 		 90 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  32.28 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  32.37 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  28.72 
 
 		 428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  23.75 
 
 		 476 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  26.56 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4350  integrase family protein  24.12 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  23.97 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.68 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  20.85 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  37.25 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  24.39 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  24.39 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.76 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  36.8 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.88 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  35.2 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  35.2 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  33.8 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  22.9 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  24.7 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  22.37 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  24.63 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.49 
 
 		 251 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.9 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  24.68 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  23.93 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.27 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  23.64 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.62 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  22.32 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  23.98 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  24.07 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  19.86 
 
 		 296 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  23.75 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.71 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  22.83 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  24.91 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  22.93 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.02 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.22 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4272  integrase family protein  21.55 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0641822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.15 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  23.17 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  23.41 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  23.22 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.43 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  45.16 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.87 
 
 		 395 aa  46.2  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  22.84 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  22.22 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1017  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0440345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  33.78 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  28.92 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.27 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  24.54 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  24.29 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  29.3 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  23.68 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  24.26 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.43 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  22.85 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  21.72 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.55 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  31 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  20.08 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  20.08 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  23.89 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.07 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.07 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  37.7 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.49 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  26.89 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.68 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.68 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.82 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  25.78 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  22.22 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>