More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1239 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  810    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  61.54 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  43.31 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  30.46 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  30.13 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  27.85 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  24.19 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.2 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  28.69 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  28.69 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  28.69 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.3 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.22 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.63 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.01 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.37 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.66 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.3 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.27 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  30.51 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.22 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.68 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.28 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.88 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.86 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.25 
 
 		 255 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.24 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  28.01 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.36 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.76 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.2 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.78 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.24 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.45 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.39 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.21 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.71 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.21 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  29.96 
 
 		 293 aa  93.6  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.94 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  28.42 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  26.76 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.21 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.87 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  21.8 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.87 
 
 		 446 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.59 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.32 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.46 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.64 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.01 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.94 
 
 		 416 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.63 
 
 		 443 aa  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  23.83 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.52 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.52 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  24.2 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.69 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.19 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.09 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.25 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.51 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.2 
 
 		 454 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  27.71 
 
 		 273 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.65 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  22.71 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.44 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  22.83 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.89 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.08 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  23.7 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  30.97 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.4 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  22.66 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  24.16 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.92 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.85 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  22.38 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  22.38 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.13 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  24.16 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  22.96 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.52 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.35 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>