36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2948 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  792    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  25.93 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26811  hypothetical protein  25 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00391  hypothetical protein  25.73 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  26.07 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.83 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28471  hypothetical protein  26.91 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.23 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  28.27 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  28.18 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  27.32 
 
 		 440 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  25.18 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  27.32 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 218 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  27.03 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  27.27 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21961  hypothetical protein  23.39 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.38 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  21.05 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15311  hypothetical protein  20.94 
 
 		 503 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  22.86 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  28.65 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.02 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.6 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  22.81 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.44 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.65 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>