46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3541 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  100 
 
 		 452 aa  949    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  74.88 
 
 		 481 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  71.43 
 
 		 368 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  54.61 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 424 aa  173  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1845  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.283171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.75 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  24.22 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  23.63 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  23.39 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  23.68 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  26.43 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26811  hypothetical protein  28.62 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3395  hypothetical protein  52 
 
 		 123 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  25 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  25.73 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.96 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.37 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00408  site-specific recombinase, phage integrase family protein  44.78 
 
 		 63 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  29.47 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.25 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15311  hypothetical protein  20.65 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  22.48 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  27.95 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.6 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  29.75 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  25.53 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  30.25 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  23.53 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.82 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  21.97 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  45.16 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.75 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25.15 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  26.92 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 		 172 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  31.67 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  31.18 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  23.6 
 
 		 159 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  30.23 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  21.97 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  21.97 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>