75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3198 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  100 
 
 		 481 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  74.88 
 
 		 452 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  91.3 
 
 		 368 aa  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  54.65 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1845  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.283171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.42 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  23.53 
 
 		 440 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  23.19 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  23.19 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  26.93 
 
 		 413 aa  87  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  23.19 
 
 		 440 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26811  hypothetical protein  25.18 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.58 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  23.7 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.15 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.91 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  25.94 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.6 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.16 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  22.58 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  24.16 
 
 		 384 aa  53.9  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  29.52 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.9 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  26.02 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.44 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 392 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  27.38 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.81 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.07 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  24.27 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  22.44 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  25.99 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.9 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  41.79 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  21.11 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.39 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  23.17 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  23.17 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  23.17 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  19.88 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  22.58 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  20.57 
 
 		 381 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.34 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  22.83 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.31 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  20.85 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.76 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.55 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  22.71 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.71 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  40 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  30.28 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15311  hypothetical protein  30.12 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  26.4 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  22.19 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  26.49 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  21.49 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  22.26 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  26.49 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  29.38 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  39.71 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>