83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3235 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  100 
 
 		 395 aa  819    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  49.29 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  41.21 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  40.85 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  34.92 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  32.18 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  34.27 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  31.91 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.9 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  28.31 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  38.79 
 
 		 209 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  44.2 
 
 		 147 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  27.14 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  33.33 
 
 		 216 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  24.81 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  25.18 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  32.74 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  24.15 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.31 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.88 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.27 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  23.92 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  30.63 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  23.08 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  23.81 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  27.06 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  22.89 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  20.77 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 481 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  26.02 
 
 		 311 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  20.77 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  24.89 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.89 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.22 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 452 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 440 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  23.18 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.11 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  21.51 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  21.78 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  22.8 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  22.64 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.78 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.2 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  23.06 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.32 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  25.4 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  26.01 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.37 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  22.95 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  28.57 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  22.39 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  53.85 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  21.03 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  25.61 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  23.32 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.81 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  21.03 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  28.57 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  25.81 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.26 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.34 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  29.19 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  28.57 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  32 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  21.92 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  24.72 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.15 
 
 		 535 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  24.81 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  21.25 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  21.25 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  21.25 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>