17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3943 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  47.72 
 
 		 384 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  38.79 
 
 		 395 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  34.54 
 
 		 385 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  34.15 
 
 		 403 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  36.06 
 
 		 391 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  26.6 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.43 
 
 		 426 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  27.5 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25.99 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.17 
 
 		 430 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.28 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.28 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  26.98 
 
 		 363 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  27.42 
 
 		 428 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  24.88 
 
 		 396 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.74 
 
 		 428 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>