76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0697 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  100 
 
 		 387 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  41.21 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  40.89 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  32.84 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  33.04 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  27.08 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25.98 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  29.09 
 
 		 384 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  25.53 
 
 		 473 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  25.65 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  27.47 
 
 		 216 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  26.75 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  25.66 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  29.95 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  30.77 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  27.5 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  21.88 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.48 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.94 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.76 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  22.27 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.63 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.05 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.49 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.52 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.56 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.23 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.08 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  23.14 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  23.13 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  24.29 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  21.85 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  24.7 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  22.59 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  30.39 
 
 		 388 aa  46.2  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.4 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.81 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.56 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.99 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  26.84 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  23.31 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.18 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.43 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.67 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  20.09 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  22.84 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  24.21 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  24.8 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  28.15 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.59 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  22.09 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 275 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  22.84 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  21.93 
 
 		 311 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.21 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  21.95 
 
 		 410 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  22.08 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  22.18 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>