49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0543 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  860    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  36.6 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  37.44 
 
 		 440 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  36.36 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  35.65 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.52 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.09 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  26.43 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 481 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  27.97 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  27.03 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  23.74 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  22.11 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  25.55 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  26.91 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  23.4 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  25.79 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  30.73 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  22.4 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  24.73 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  24.7 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  23.71 
 
 		 363 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  25 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0786  hypothetical protein  25.27 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0317097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.49 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  22.99 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.49 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  20.55 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  24.55 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  23.31 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  21.9 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25.34 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  23.72 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.97 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>