125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0145 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  100 
 
 		 363 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  37.53 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  41.64 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  34.78 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  31.91 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  34.73 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  32.33 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  33.15 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  31.73 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  41.61 
 
 		 216 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  28.25 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  33.82 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  29.79 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  29.41 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  28.27 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  41.94 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.67 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  27.02 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.96 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.41 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  25.51 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.4 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  22.49 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.7 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  21.02 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  30.12 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  21.23 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  27.27 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.27 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.34 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  26.34 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  27.49 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.51 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.55 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.85 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  28.4 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  24.81 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.94 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.27 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  25.97 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.37 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.42 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  25.45 
 
 		 431 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  29.58 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.3 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.38 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  22.67 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.88 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  23.33 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  25 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  27.27 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.91 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.94 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  26.98 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  30.19 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.04 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 452 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  22.97 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  20.73 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  20.48 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  24 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  25.43 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  23.98 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  23.95 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.19 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  24.89 
 
 		 492 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.64 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.09 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  25.53 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  25 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  25.99 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  23.71 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.26 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  25.65 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25 
 
 		 287 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.81 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  20.79 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  21.6 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  23.39 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  23.46 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  23.48 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.92 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>