62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0559 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  100 
 
 		 464 aa  927    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  60.18 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  58.64 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  56.58 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  55.73 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  52.18 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  67.14 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  43.84 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  43.13 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  42.95 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  42 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  36.97 
 
 		 470 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  53.15 
 
 		 226 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  71.17 
 
 		 114 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  57.47 
 
 		 89 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  51.69 
 
 		 106 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  48.94 
 
 		 104 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  51.56 
 
 		 66 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.48 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.77 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.55 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.81 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.37 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.26 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.66 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.27 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.79 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.8 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.82 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.1 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.1 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.54 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  22.94 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.54 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  28.93 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.43 
 
 		 363 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.84 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.69 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  28.57 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.77 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.47 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.34 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.48 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  21.47 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  28.03 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.56 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  36.21 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  38.81 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  26.04 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  27.23 
 
 		 201 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 198 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.23 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.49 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  27.07 
 
 		 354 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.86 
 
 		 369 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>