112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6841 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  100 
 
 
492 aa  1005    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  43.69 
 
 
433 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  42.8 
 
 
464 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  44.2 
 
 
456 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  41.89 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  44.08 
 
 
456 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  41.79 
 
 
454 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  40.3 
 
 
477 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  39.82 
 
 
467 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  41.36 
 
 
454 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  47.27 
 
 
283 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  33.41 
 
 
470 aa  220  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  51.85 
 
 
226 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  54.46 
 
 
114 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  59.38 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  44.35 
 
 
106 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  57.35 
 
 
66 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  44.83 
 
 
89 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.72 
 
 
385 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.63 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 
386 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.22 
 
 
385 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.63 
 
 
368 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  43.75 
 
 
356 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.08 
 
 
390 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.67 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  22.89 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  31.25 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.83 
 
 
471 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.05 
 
 
477 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.69 
 
 
435 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  26.59 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.27 
 
 
378 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  28.98 
 
 
354 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1308  phage integrase family protein  38.78 
 
 
128 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0654905  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  28.78 
 
 
218 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.07 
 
 
302 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  30.11 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.85 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.07 
 
 
302 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  26.32 
 
 
336 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.29 
 
 
375 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.41 
 
 
412 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 
302 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.37 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  24.34 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.09 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  28.57 
 
 
383 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.01 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  25.95 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 
297 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  22.01 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  25.08 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  27.07 
 
 
344 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  29.71 
 
 
364 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  29.71 
 
 
364 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  24.89 
 
 
363 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  29.82 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.68 
 
 
300 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  23.14 
 
 
387 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  23.63 
 
 
396 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  21.24 
 
 
297 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.24 
 
 
297 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  25.44 
 
 
304 aa  46.6  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.39 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  27.12 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  25.12 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  28.97 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  26.84 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.17 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  21.12 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  30.94 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  26.86 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.57 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  23.56 
 
 
322 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.98 
 
 
323 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  23.68 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  22.22 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.08 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  28.98 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  30 
 
 
465 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  33.56 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  25.3 
 
 
285 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.69 
 
 
635 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  21.46 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  27.27 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  34.34 
 
 
311 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>