72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0691 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  922    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  65.86 
 
 		 456 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  65.13 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  57.4 
 
 		 454 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  56.36 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  53.7 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  43.53 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  60.85 
 
 		 283 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  43.42 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  40.77 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  42.01 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  37.82 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  49.54 
 
 		 226 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  66.37 
 
 		 114 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  50.56 
 
 		 89 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  53.93 
 
 		 106 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  48.39 
 
 		 66 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.96 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.57 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.86 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.08 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  28.98 
 
 		 354 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.95 
 
 		 365 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.02 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.89 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  21.56 
 
 		 337 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.75 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.78 
 
 		 396 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  20.43 
 
 		 494 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  30.48 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  24.35 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  23.81 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  37.93 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  37.93 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  27.64 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  32.74 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.15 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.79 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.61 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.96 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.4 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  22.79 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.42 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.75 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  22.39 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.11 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.91 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.53 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  28 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.37 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.58 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.44 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  21.53 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  26.73 
 
 		 306 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  44.19 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.29 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.73 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  26.25 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  41.67 
 
 		 139 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>