54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0148 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  921    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  79.52 
 
 
456 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  65.13 
 
 
454 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  58.42 
 
 
464 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  56.7 
 
 
454 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  53.1 
 
 
433 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  44.52 
 
 
459 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  63.54 
 
 
283 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  43.33 
 
 
467 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  44.08 
 
 
492 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  40.26 
 
 
470 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  39.57 
 
 
477 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  53.02 
 
 
226 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  66.37 
 
 
114 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  51.69 
 
 
106 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  51.14 
 
 
104 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.62 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.69 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  51.61 
 
 
66 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.36 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.28 
 
 
414 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.86 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.09 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.73 
 
 
386 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.97 
 
 
387 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.35 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  28.89 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.76 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.57 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  27.75 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.76 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.91 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.75 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.06 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.91 
 
 
379 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  21.74 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.28 
 
 
363 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.23 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  27.27 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.24 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.77 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.78 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  31.31 
 
 
306 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.09 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  23.65 
 
 
363 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.1 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.73 
 
 
377 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  29.27 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.24 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  24.8 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.48 
 
 
376 aa  43.5  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  22.44 
 
 
396 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>