30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4454 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  100 
 
 		 477 aa  981    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  40.3 
 
 		 492 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  41.58 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  38.81 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  39.75 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  40.76 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  40.47 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  39.74 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  37.61 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  38.88 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  32.85 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  40.7 
 
 		 283 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  50.22 
 
 		 226 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  97.87 
 
 		 106 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  49.38 
 
 		 89 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  52.54 
 
 		 66 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.08 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.08 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.09 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.24 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  30.71 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  31.3 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.72 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  33.88 
 
 		 229 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.59 
 
 		 370 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  38.3 
 
 		 356 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>