75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4373 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  57.07 
 
 		 467 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  51.85 
 
 		 492 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  50.69 
 
 		 454 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  51.39 
 
 		 456 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  52.34 
 
 		 456 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  53.15 
 
 		 464 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  50.69 
 
 		 283 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  50.22 
 
 		 477 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  49.55 
 
 		 433 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  49.08 
 
 		 454 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  46.02 
 
 		 459 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  40.19 
 
 		 470 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  56.84 
 
 		 104 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  47.32 
 
 		 114 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  51.69 
 
 		 106 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  53.33 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  34.09 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  22.03 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.91 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  24.88 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 323 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.43 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.9 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 403 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  32.43 
 
 		 368 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 321 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  26 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.69 
 
 		 324 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 		 320 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  33.09 
 
 		 398 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.32 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  22.81 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 329 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.04 
 
 		 477 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.25 
 
 		 310 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 351 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  37.35 
 
 		 385 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  25.94 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.15 
 
 		 363 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30 
 
 		 378 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  27.06 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.24 
 
 		 409 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  25.13 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  25.35 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  28.69 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 322 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  32 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.6 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  22.22 
 
 		 384 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  26.76 
 
 		 323 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.34 
 
 		 313 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  34.72 
 
 		 356 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.24 
 
 		 317 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  25.81 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  29.07 
 
 		 332 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 311 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  21.97 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.24 
 
 		 320 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  26.24 
 
 		 320 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  26.63 
 
 		 329 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.73 
 
 		 320 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.94 
 
 		 355 aa  42.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  29.52 
 
 		 331 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  25.25 
 
 		 323 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  22.97 
 
 		 494 aa  42  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 311 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  32.46 
 
 		 433 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 471 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  21.65 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>