55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0598 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  66.43 
 
 		 464 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  62.28 
 
 		 456 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  59.93 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  63.54 
 
 		 456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  56.04 
 
 		 433 aa  305  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  56.36 
 
 		 454 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  47.27 
 
 		 492 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  47.29 
 
 		 459 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  48.7 
 
 		 467 aa  228  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  40.07 
 
 		 470 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  40.7 
 
 		 477 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  50.69 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  72.07 
 
 		 114 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  64.29 
 
 		 89 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  49.44 
 
 		 104 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  48.31 
 
 		 106 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  46.77 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.1 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  20.16 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.32 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.57 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  22.09 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.09 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  24.03 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.71 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.12 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.32 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  30.21 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  21.32 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.27 
 
 		 396 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.51 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 383 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 		 435 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  24.25 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  27.84 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.62 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.87 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.33 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  24.9 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  36.73 
 
 		 396 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.18 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  30.49 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  32.46 
 
 		 365 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  23.24 
 
 		 357 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1308  phage integrase family protein  31 
 
 		 128 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0654905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  29.06 
 
 		 201 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>