More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0327 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  49.21 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  45.86 
 
 
309 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  31.4 
 
 
449 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  34.83 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  31.69 
 
 
333 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  38.18 
 
 
330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  38.18 
 
 
330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  38.18 
 
 
330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  38.18 
 
 
330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  33.44 
 
 
307 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  32.11 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  33.01 
 
 
315 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  32.17 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  31.73 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  31.91 
 
 
316 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  31.43 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  33.22 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  30.06 
 
 
326 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  33.2 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  32.38 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  30.97 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  32.48 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  34.48 
 
 
310 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  30.48 
 
 
313 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  30.48 
 
 
313 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  30.48 
 
 
313 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  31.19 
 
 
332 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  30.79 
 
 
312 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 
312 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  27.69 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  30.9 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  30.9 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  30.93 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  29.45 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.37 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.76 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  34.05 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  33.62 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  34.05 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.47 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.14 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.69 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  26.67 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  31.14 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  33.19 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  31.14 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.57 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  31.14 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  32.56 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  38.61 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  31.14 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  23.67 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.91 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.49 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  31.25 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.26 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.34 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  30.2 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  29.9 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  31.54 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  34.07 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  33.5 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.9 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.91 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  33.13 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.31 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  30.81 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  34.48 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.22 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.7 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>