20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2961 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  59.02 
 
 		 459 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  57.35 
 
 		 492 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  55.93 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  53.33 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  56.9 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  51.56 
 
 		 464 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  52.54 
 
 		 477 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  50.82 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  52.46 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  48.39 
 
 		 454 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  46.77 
 
 		 283 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  53.33 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  51.61 
 
 		 456 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  50 
 
 		 433 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  50.85 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  46.77 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  39.66 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  40 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  32.35 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>