17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0976 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  967    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  40.56 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  38.55 
 
 
454 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  40.26 
 
 
456 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  39.61 
 
 
456 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  36.54 
 
 
464 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  37.92 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  37.83 
 
 
459 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  36.74 
 
 
467 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  32.85 
 
 
477 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  40.07 
 
 
283 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  33.41 
 
 
492 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  40.19 
 
 
226 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  35.09 
 
 
114 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  32.22 
 
 
106 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>