25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4456 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  97.87 
 
 
477 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  53.93 
 
 
454 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  53.33 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  51.69 
 
 
464 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  52.81 
 
 
433 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  54.95 
 
 
456 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  56.25 
 
 
459 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  44.35 
 
 
492 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  51.69 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  51.69 
 
 
456 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  48.31 
 
 
283 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  51.69 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  57.14 
 
 
467 aa  80.1  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  44.94 
 
 
454 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  50.85 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  37.5 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  43.4 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  32.22 
 
 
470 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  43.75 
 
 
407 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  43.4 
 
 
422 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  43.4 
 
 
422 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.95 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  42.86 
 
 
407 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>