159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24051 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  58.13 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.19 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  25.55 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  25.27 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.47 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  32.65 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  33.33 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.75 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  34.3 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.25 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.04 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.04 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.32 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.8 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  32.8 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  30.43 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.33 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.22 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.38 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.35 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.04 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  30.26 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  21.23 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  28.64 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.09 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.56 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  24.86 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  24.86 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.86 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.56 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  25 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  31.61 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.57 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.91 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.76 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.14 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.23 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.98 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.58 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.2 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.41 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.13 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  23.87 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  26.63 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  31.14 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.71 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.61 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.39 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.21 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.19 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.92 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  27.72 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.66 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.75 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.84 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  30.07 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.05 
 
 		 385 aa  52.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  28.98 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.6 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.18 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.77 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.05 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.05 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.76 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.03 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.05 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  24.71 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.95 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.02 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.83 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.78 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  28.57 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  24.44 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  32.43 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  25.47 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  23.77 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.57 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.9 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  23.81 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.32 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>