96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00310 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 429 aa  894    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  54.65 
 
 		 481 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  54.61 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  51.88 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1845  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.283171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00408  site-specific recombinase, phage integrase family protein  90.48 
 
 		 63 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.83 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  23.95 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  24.07 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  27.09 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  23.72 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  23.95 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  24.24 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26811  hypothetical protein  23.42 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  24.8 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  22.82 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  22.82 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  22.82 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  22.82 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  36.18 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.14 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  22.54 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.12 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.19 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 209 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.46 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  27.46 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  31.71 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  20.97 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  21.66 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  45.16 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  21.86 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3395  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 304 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  26.32 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  25.4 
 
 		 505 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  24.62 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.47 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  38.71 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  22.3 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  23.35 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.95 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  24.9 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  23.26 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.27 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 295 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 295 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  37.25 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  34.62 
 
 		 335 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 		 172 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  53.85 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.69 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  25.85 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  26 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  25.85 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  23.48 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  22.7 
 
 		 159 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  25.85 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  25.49 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  24.6 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  21.12 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  20.73 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  32.98 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.91 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  23.76 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  21.41 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  21.41 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  28.99 
 
 		 160 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  20.23 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  28.25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.9 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  46.67 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.11 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.84 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 372 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  36.67 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  22.46 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  24.17 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.95 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  25.56 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21961  hypothetical protein  20.11 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  24.7 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  27.1 
 
 		 323 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.29 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  27.1 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  21.77 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>