34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2345 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 395 aa  820    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  27.57 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  27.12 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  27.27 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  27.45 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  26.52 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  24.7 
 
 		 479 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.83 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  27.84 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  26.25 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1845  phage integrase family protein  22.04 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.283171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  29.83 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  21.44 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26811  hypothetical protein  24.69 
 
 		 525 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  50 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.31 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  24.35 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  21.33 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.25 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  22.87 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  26.82 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0786  hypothetical protein  29 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0317097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  32 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.17 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  43.18 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  23.66 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.21 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  29.56 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>