30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0101 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  97.05 
 
 		 440 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  894    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  95 
 
 		 440 aa  838    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  96.59 
 
 		 440 aa  853    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  36.6 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.57 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.95 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 424 aa  93.6  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  23.19 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  23.39 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  37.25 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00391  hypothetical protein  22.35 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  29.21 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  21.15 
 
 		 467 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  28.72 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.65 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.2 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  20.7 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  29.41 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  28.57 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.19 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 283 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.43 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  35.11 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>