More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1820 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  39.01 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  29.54 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.13 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.97 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  32.19 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.42 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  29.86 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.31 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.97 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  40.99 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  28.67 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.75 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  29.12 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.5 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  29.76 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.13 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  31.7 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  30.96 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.68 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.4 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.6 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.27 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  31.3 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 296 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.58 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  27.08 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.67 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.62 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  27.53 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  27.94 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  30.71 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  29.37 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  27.74 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 305 aa  96.3  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  29.87 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  28.15 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  35.54 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.68 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  26.95 
 
 		 322 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 319 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.99 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.88 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.92 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>