36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0086 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  96.14 
 
 		 440 aa  845    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0101  integrase family protein  96.59 
 
 		 440 aa  870    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0086  integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  896    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0117  integrase family protein  96.59 
 
 		 440 aa  848    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  35.65 
 
 		 413 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.75 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.72 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  23.63 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2067  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  23.39 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2804  hypothetical protein  32.5 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00391  hypothetical protein  22.14 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  35.2 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.15 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28491  hypothetical protein  28.41 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1694  phage integrase family protein  20.76 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.37 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.5 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.65 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  20.7 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007516  Syncc9605_1668  hypothetical protein  28.21 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.810968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 283 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.37 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  28.57 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  30.32 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.43 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.33 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1084  hypothetical protein  39.66 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  23.58 
 
 		 310 aa  43.1  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>