More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1994 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  100 
 
 		 315 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  50 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  44.67 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  29.39 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25.8 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  35.19 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.48 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  32.59 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.81 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.82 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  29.53 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  30.67 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.68 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  27.93 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  22.58 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.05 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.03 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.09 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  33.04 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.97 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  29.05 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.33 
 
 		 332 aa  85.9  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.43 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.43 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4231  integrase/recombinase  26.6 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  28.44 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.08 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.59 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  23.2 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  30.77 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.35 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  32.46 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.25 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  28.43 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.15 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.46 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  26.73 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.94 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  23.61 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.33 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.45 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.33 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.95 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.33 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  27.78 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.68 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.41 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.38 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  28.41 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  28.94 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  26.97 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  27.92 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>