143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2605 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  100 
 
 		 376 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  45.83 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  29.08 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  36.95 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  31.19 
 
 		 396 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  28.29 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  30.51 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  30.35 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  29.79 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  24.81 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  32 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  33.5 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  37.23 
 
 		 147 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  31.31 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  28.74 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  30.05 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  29.5 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  30.57 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.66 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  25.11 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  31.19 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.97 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  28.25 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  28.51 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  30.5 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.19 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.98 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.47 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.7 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.89 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  28.4 
 
 		 190 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.94 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  28.57 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.82 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.72 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.79 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  25.23 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.34 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.96 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.12 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  28.35 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.7 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.85 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.53 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.68 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.52 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.52 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.52 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.22 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  23.53 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  31.49 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.64 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  25.93 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.12 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.03 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.6 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.11 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  32 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.69 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.21 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  26.03 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.34 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  22.69 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.54 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  22.69 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  23.38 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  30.92 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  29.68 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  29.68 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  29.68 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  29.68 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  25 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  25.74 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  27.93 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.21 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.83 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  23.79 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  30.71 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  25.83 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  22.51 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  25.66 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.6 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  22.41 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.19 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.71 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.4 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  22.22 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>