87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4380 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  100 
 
 		 470 aa  960    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  60.61 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  29.96 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  25.94 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  27.2 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  25.87 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  23.85 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.64 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.64 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.64 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 337 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  25.57 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.26 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  31.49 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.27 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  24.48 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.45 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  28.49 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.3 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  22.97 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  22.97 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.3 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  24 
 
 		 327 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.88 
 
 		 325 aa  50.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  19.95 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.17 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.63 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.5 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.75 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.3 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  21.8 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  26.32 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  22.99 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  23.03 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.15 
 
 		 346 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  21.97 
 
 		 330 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  23.58 
 
 		 388 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  25.38 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.29 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  31.46 
 
 		 381 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  23.24 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.97 
 
 		 359 aa  46.6  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 324 aa  46.6  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  20.48 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  22.09 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  23.97 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  22.3 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  23.64 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.62 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  26.58 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5363  prophage lambdaba03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.98 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.49 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.39 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  24.55 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  23.95 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.97 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4984  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.98 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.39 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.77 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  26.22 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.3 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.64 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  23.67 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.37 
 
 		 311 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.04 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  28.1 
 
 		 258 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.51 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  21.43 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  29.73 
 
 		 273 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  26.01 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  22.22 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.3 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>