218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2427 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  100 
 
 		 414 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  31.54 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  31.3 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.33 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.66 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  27.42 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  31.67 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  27.02 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  30.81 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.87 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  26.9 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.01 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.58 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32.62 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  26.72 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.59 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.54 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.7 
 
 		 337 aa  67  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  31.35 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  22.43 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.95 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  24.76 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  23.17 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.43 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.72 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.31 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  25.35 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  31.32 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  26.63 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.6 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  28.93 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  21.15 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  28.17 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  29.83 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  23.13 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  22.39 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  28.09 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  28.86 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  25.31 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  25.31 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  25.81 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  24.57 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  24.58 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  25.31 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4272  integrase family protein  27.22 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0641822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  31.5 
 
 		 146 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  23.72 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  26.9 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  27.98 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 322 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  25.68 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  30 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.47 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  28.22 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  25.13 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  25.51 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  31.61 
 
 		 571 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.62 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.41 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.61 
 
 		 251 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  22.3 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.41 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.96 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  25.2 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.48 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  23.02 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.65 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  29.29 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.89 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  23.97 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.89 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.78 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  23.48 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>