22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3119 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  100 
 
 		 427 aa  852    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4350  integrase family protein  40.04 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  26.61 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  27.29 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  25.5 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  26.92 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.35 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  26.65 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.58 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  29.44 
 
 		 284 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.58 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.37 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  26.85 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  25 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  27.96 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.3 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.33 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25.98 
 
 		 329 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  39.71 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  39.71 
 
 		 368 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>