More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4785 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3700  phage integrase family protein  32.98 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2674  phage integrase family protein  32.62 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3710  phage integrase family protein  31.56 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3617  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  33.98 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.9 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.66 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  32.9 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  30 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  37.02 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.95 
 
 		 315 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  34.68 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  33.19 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.17 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  28.92 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  29.8 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  32.58 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  31.31 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.95 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.77 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  34.26 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  32.35 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.36 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  33.33 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.95 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.08 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  27.4 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  31.42 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.09 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  31.53 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.98 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  32.56 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 303 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  27.89 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  30.37 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.17 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  28.33 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  29.48 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  30.36 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 306 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.81 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  32.59 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.53 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.95 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  37.17 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  28.91 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.42 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.58 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.99 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  33.05 
 
 		 346 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.73 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.46 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  38.99 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  29.14 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.71 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.16 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.38 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>