More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3098 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  100 
 
 		 428 aa  885    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  51.28 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  47.27 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  45.63 
 
 		 363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  40.28 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  35.87 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  26.39 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  27.55 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  27.49 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  27.49 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.58 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.05 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.09 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  28.07 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.7 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.97 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  28.07 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  25.73 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.55 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.94 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.94 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  29.59 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.36 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.82 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.94 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  29.1 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  28.97 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.27 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.56 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.27 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.51 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.72 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4350  integrase family protein  24.46 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.21 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.64 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  31.22 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.21 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  31.22 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.57 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.19 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.34 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  32.39 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.3 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  33.33 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  28.22 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  28.22 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.03 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  25.68 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  34 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.63 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  28.64 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.12 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.18 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  31.33 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  31.33 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  28.17 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.67 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  30.32 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  26.4 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  30.32 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  26.59 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  28.65 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.11 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.36 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.22 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  24.56 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.46 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.38 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.55 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  29.48 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  28.37 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.25 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  26.54 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  24.48 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.7 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.48 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  24.17 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.24 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.55 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>