169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6370 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  100 
 
 		 438 aa  891    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.76 
 
 		 416 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.37 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.4 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.79 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.61 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.49 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.1 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.96 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.08 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.1 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.74 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  20.18 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  19.88 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.17 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  24.81 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.29 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.9 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.32 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.03 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.92 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.27 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.6 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.27 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.46 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.6 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.05 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.69 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.93 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.41 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.9 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.53 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22.88 
 
 		 301 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.52 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.81 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.26 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.66 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  26 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.13 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.27 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.54 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.45 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.16 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  21.67 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  24.6 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.41 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.94 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.94 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  23.97 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  23.33 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.35 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  25.6 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  30.2 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  21.99 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.46 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.09 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.3 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  20.16 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.78 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.72 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  27.84 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  23.18 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  20 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.33 
 
 		 309 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  20.33 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.78 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  20.53 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.28 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  20.6 
 
 		 383 aa  50.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  29.15 
 
 		 290 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.26 
 
 		 376 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  20.2 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.1 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.07 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.77 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  20.56 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>