More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1932 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  100 
 
 		 379 aa  782    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  68 
 
 		 375 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  43.78 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  27.2 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.47 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 345 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 345 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.3 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  25.87 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.92 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.51 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.51 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.73 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  27.3 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.67 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.96 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.53 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.12 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  25 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.31 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  22.32 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  22.32 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.61 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.79 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.79 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.19 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.38 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.69 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.65 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.93 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  24.6 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.21 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.68 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.51 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.17 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.41 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  22.92 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  21.53 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  23.4 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.44 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.87 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  23.32 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.12 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.5 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  27.37 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.34 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  21.55 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.13 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.14 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  25.14 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.34 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.48 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.48 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.94 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.43 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.58 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.69 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  30 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.37 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  20.14 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.41 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.37 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.41 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  25.93 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.37 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  21.86 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.17 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  22.19 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.06 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  26.78 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.7 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  24.86 
 
 		 308 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  24.26 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.81 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  23.19 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.14 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.02 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.73 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  22.16 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.73 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.25 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  27.65 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  21.79 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  23.49 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.65 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>