More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1085 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  858    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  67.31 
 
 
417 aa  597  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  46.91 
 
 
406 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  42.64 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  35.1 
 
 
486 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  37.32 
 
 
409 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  30.86 
 
 
476 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  32.98 
 
 
410 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  29.19 
 
 
412 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  28.6 
 
 
425 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.98 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  29.64 
 
 
448 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  28.23 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  25.16 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  26.2 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  26.79 
 
 
441 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  24.41 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  25.24 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  25.24 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.28 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  27.07 
 
 
515 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  25.94 
 
 
452 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  25.46 
 
 
479 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  26.76 
 
 
400 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  25.29 
 
 
449 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.4 
 
 
402 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.93 
 
 
389 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.86 
 
 
400 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.91 
 
 
384 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.99 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.44 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.04 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.05 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.36 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.79 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.07 
 
 
393 aa  93.2  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.68 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  25.47 
 
 
442 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25.8 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  26.65 
 
 
384 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  26.34 
 
 
399 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.96 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.28 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.34 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.34 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.34 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.63 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.33 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  22.96 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.03 
 
 
401 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  23.6 
 
 
449 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  22.86 
 
 
505 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  22.86 
 
 
505 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  22.14 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  25.19 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.59 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  23.17 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  26.58 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.15 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  26.13 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.59 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.63 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.41 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  21.45 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.93 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  21.92 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  24.81 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.81 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.25 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.57 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  25.84 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.12 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  23.61 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  23.45 
 
 
486 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.47 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.73 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  23.23 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  22.93 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.86 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.18 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.27 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  23.38 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.98 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  31.54 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.97 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  21.62 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  23.9 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.89 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  23.91 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.23 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  22.66 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  23.75 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  25.19 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  24.38 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  23.23 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.12 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23.72 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  23.02 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>