32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0474 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  69.23 
 
 
515 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  100 
 
 
442 aa  901    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  60 
 
 
505 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  60 
 
 
505 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  47.94 
 
 
255 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.33 
 
 
424 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  27.75 
 
 
375 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.07 
 
 
417 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.89 
 
 
406 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.81 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.01 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0569  hypothetical protein  52.38 
 
 
114 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.1 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  22.36 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  22.71 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  21.21 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.27 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.51 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.44 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  23.76 
 
 
476 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  23.61 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.26 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  21.47 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25 
 
 
411 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.09 
 
 
397 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  24.87 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  22.55 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  35.71 
 
 
422 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  22.69 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  28.12 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  28.93 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  22.22 
 
 
419 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>