118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0094 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  100 
 
 
449 aa  906    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  73.65 
 
 
472 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  65.32 
 
 
457 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  65.32 
 
 
457 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  63.93 
 
 
479 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  50.33 
 
 
441 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  43.98 
 
 
452 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  44.04 
 
 
435 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  38.55 
 
 
440 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  39.37 
 
 
450 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.73 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.63 
 
 
417 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  24.31 
 
 
406 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25.29 
 
 
413 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.55 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.26 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.6 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.11 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  23.78 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.63 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.94 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.84 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.83 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.39 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  23.74 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.89 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  22.94 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  26.95 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  22.94 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.89 
 
 
451 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  22.45 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  29.71 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  20.7 
 
 
448 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3737  hypothetical protein  47.5 
 
 
150 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  24.38 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  23.93 
 
 
434 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  20.98 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  22.93 
 
 
414 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  24.94 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  20.97 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  24.73 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  23 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  21.56 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.21 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  22.46 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  22.57 
 
 
384 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  36.19 
 
 
159 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  21.19 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.97 
 
 
370 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  31.33 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.29 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.19 
 
 
325 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.77 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  22.68 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  31.39 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.39 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  23.55 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  22.32 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  24.57 
 
 
413 aa  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  22.43 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.04 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.89 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  27.91 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.51 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  28.14 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.89 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.03 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  37.36 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  22.2 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.73 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.03 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  22.03 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.06 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  36.84 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  22.48 
 
 
402 aa  47.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  23.68 
 
 
412 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.46 
 
 
399 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  28 
 
 
429 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  21.82 
 
 
400 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  22.56 
 
 
401 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.82 
 
 
385 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  28.99 
 
 
395 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.4 
 
 
477 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  33.33 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.57 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  22.41 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  28.7 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  21.89 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  20.26 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  22.53 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.67 
 
 
363 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.06 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.28 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.28 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  30.68 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.91 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  24.53 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  22.51 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.49 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>