38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0402 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1024    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1024    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  58.81 
 
 
515 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  58.55 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  51.35 
 
 
255 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  28.95 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  28.07 
 
 
424 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.18 
 
 
417 aa  96.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.09 
 
 
406 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.28 
 
 
409 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  23.82 
 
 
425 aa  84  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  22.71 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  22.86 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  22.06 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0569  hypothetical protein  48.84 
 
 
114 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.58 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.44 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.26 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.2 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  22.22 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  24.91 
 
 
384 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.21 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.03 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.73 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  24.84 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  23.66 
 
 
181 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23.18 
 
 
404 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.66 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.99 
 
 
384 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.26 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  25.91 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  22.75 
 
 
420 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  24.48 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.08 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  23.62 
 
 
426 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  22.38 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  24.53 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  22.96 
 
 
420 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>