206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1655 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  100 
 
 		 420 aa  874    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  65.71 
 
 		 418 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  65.95 
 
 		 418 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  65.71 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  65.71 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  65.62 
 
 		 417 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  57.28 
 
 		 422 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  56.8 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  57.04 
 
 		 422 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  57.04 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  57.28 
 
 		 422 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  57.04 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  56.8 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  56.56 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  56.8 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  34.55 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  35.05 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  34.77 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  33.16 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  31.83 
 
 		 432 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  34.18 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.79 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.79 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  25.31 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  24.44 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  24.9 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  24.71 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  22.73 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.92 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.55 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  23.64 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  23.64 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  25 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.18 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  24.29 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  23.21 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  22.96 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  21.64 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  24.46 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  24.8 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  22.79 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  23.86 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.48 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  24.26 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.27 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  27.54 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  22.48 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  21.38 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  27.05 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  23.08 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  27.27 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  22.03 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.05 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  21.38 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  21.7 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.89 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  21.63 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.45 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  20.88 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  21.38 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  23.54 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  23.05 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  23.19 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  23.19 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  23.27 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  23.19 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  24.6 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  22.34 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  27.27 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  24.92 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  23.51 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.51 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23.76 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.14 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  28.29 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  32.37 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  21.8 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  24.25 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  23.88 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  24.63 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  26.76 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  22.96 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>